In Situ Hibridizasyon
İn Situ Hybridization
Tanım
Örnek Vaka / Uygulama
Bir nörobiyoloji laboratuvarında, öğrenme sürecinden sorumlu hipokampal doku örneklerinde c-Fos erken gen ekspresyonunun hangi nöron popülasyonunda arttığını incelemek için digoksijenin ile etiketlenmiş RNA probu kullanılarak in situ hibridizasyon uygulanması.
Derin Analiz
In situ hibridizasyon (ISH), gen ekspresyonunun mekansal haritalandırılmasında ve hücresel düzeyde transkriptom analizi yapılmasında temel bir tekniktir. Yöntem, işaretlenmiş tek zincirli nükleik asit problarının (RNA, cDNA veya sentetik oligonükleotitler) hedef nükleik asit dizisiyle baz eşleşmesi (Watson-Crick komplementariteliği) yapması prensibine dayanır. Hücreler veya dokular önceden fikse edilerek morfolojik bütünlükleri korunur; böylece genlerin hangi hücre tiplerinde aktif olduğu, embriyogenez, nöroanatomi ve patolojik süreçlerde (örneğin tümör hücrelerinin tespiti) tam olarak hangi konumda eksprese edildiği mikroskop altında görselleştirilebilir. İmmünohistokimyadan temel farkı, proteinleri değil doğrudan nükleik asitleri hedef almasıdır.
Etimoloji
Latince 'in situ' [yerinde, doğal konumunda] + İngilizce 'hybridization' [melezleşme, birleşme, Yunanca hibris kökünden türetilmiştir]
Karıştırmayın
İmmünohistokimya (IHC) ile sıkça karıştırılır; IHC dokudaki protein ürünlerini tespit ederken, ISH doğrudan nükleik asit (DNA/RNA) dizilerini hedefler.